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Encyclopédie informatisée qui organise des données de manière structurée afin de pouvoir stocker efficacement de grandes quantités d’informations. Par exemple, la banque de données UniProtKB répertorie les informations sur les protéines de tous les organismes et la banque données OMA répertorie les informations sur les gènes othologues. Ces banques de données sont régulièrement mises à jour.