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Se dit de gènes ou protéines homologues qui sont le résultat d’une duplication de gènes (par exemple, l’hémoglobine alpha et l’hémoglobine bêta chez les vertébrés sont des paralogues). Souvent (mais pas toujours), les paralogues ont des rôles biologiques différents. A ne pas confondre avec avec « orthologue ».